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Título : Desarrollo de un método diagnóstico de tipo PCR múltiple para la detección de patógenos causantes de gastroenteritis aguda en niños mexicanos
Autor : DRA. ASCENCIÓN DE NOVA OCAMPO (PIBIOM), MÓNICA
DR. SALAS BENITO (PIBIOM), JUAN SANTIAGO
TOLENTINO RUÍZ, MARÍA DEL ROCÍO
Palabras clave : método diagnóstico
PCR
gastroenteritis
niños
patógenos
Fecha de publicación : 14-dic-2010
Resumen : Acute gastroenteritis is a major cause of childhood morbidity and mortality worldwide. The etiology are included viruses, bacteria and parasites, considering the viruses the leading cause of acute diarrhea, rotavirus, calicivirus, enteric adenovirus and human astrovirus (HAstV) are the most frequent, in the bacterial etiology the main agents are Escherichia coli and Shigella spp. and in the etiology parasitic Entamoeba histolytica is recognized as the leading cause worldwide. The diagnosis of these pathogens is very little specific and sensitive, its conventionally used ELISA and molecular methods currently. However, actually don´t exists there is no a molecular method to identify them simultaneously, therefore the aim of this study was to design a molecular diagnostic method for highly sensitive and specific to allow the simultaneous identification in stool samples of enteric pathogens (astrovirus, norovirus, Entamoeba histolytica , enteroinvasive Escherichia coli) in children under four years. Stool samples were analyzed to identify these pathogens by ELISA and RT-PCR/PCR. For RT-PCR identified 4 samples positive for astrovirus (3.8%) and 4 for calicivirus (3.8%) were identified; while by PCR 2 and 14 samples positive for Entameoba histolytica (10.5%) and EIEC (70%) were identified respectively. By ELISA only one sample was positive for norovirus (2.5%). The sequences of the positive samples corresponded to serotype 1 and 8 for astrovirus, Norwalk virus, and EIEC strain. Multiplex PCR was standardized with positive stool samples, achieving simultaneously amplify (astrovirus, EIEC and Entamoeba histolytica), which is a useful tool in the identification of pathogens in epidemiological studies and may provide support to the diagnosis of acute gastroenteritis in children which would represent a major impact on early diagnosis and treatment and therefore a major epidemiological change.
Descripción : La gastroenteritis aguda es una de las principales causas de morbilidad y mortalidad infantil a nivel mundial, la etiología incluye virus, bacterias y parásitos, considerando a los virus la principal causa de diarrea aguda. Los más frecuentes son rotavirus, calicivirus, adenovirus y astrovirus humanos (HAstV); en la etiología bacteriana los principales agentes son Escherichia coli y Shigella spp., y en la etiología parasitaria, se reconoce a Entamoeba histolytica como la principal causa a nivel mundial. El diagnóstico de estos patógenos es poco específico y sensible, se utiliza convencionalmente ELISA y actualmente métodos moleculares, sin embargo no existe un método molecular que los identifique simultáneamente, por lo que el objetivo del presente trabajo fue diseñar un método diagnóstico molecular altamente sensible y específico que permitiera la identificación simultánea en muestras de heces de patógenos entéricos (astrovirus, norovirus, Entamoeba histolytica, Escherichia coli enteroinvasiva) en niños menores de cuatro años. Se analizaron muestras de heces para identificar estos patógenos por ELISA y RT-PCR/PCR. Por RT-PCR se identificaron 4 muestras positivas para astrovirus (3.8%) y 4 para calicivirus (3.8%); por PCR 2 y 14 muestras positivas para Entameoba histolytica (10.5%) y EIEC (70%) respectivamente. Por ELISA únicamente se identifico una muestra positiva para norovirus (2.5%). Las muestras positivas secuenciadas correspondieron a astrovirus serotipo 1 y 8, virus Norwalk, y EIEC y se estandarizo la PCR múltiple con las muestras de heces positivas lográndose amplificar simultáneamente (astrovirus, EIEC y Entamoeba histolytica), lo que representa una herramienta útil en la identificación de patógenos en estudios de corte epidemiológico y puede servir de apoyo al diagnóstico de gastroenteritis aguda en niños lo cual representaría un gran impacto en el diagnóstico temprano y tratamiento y por ende un cambio epidemiológico importante.
URI : http://www.repositoriodigital.ipn.mx/handle/123456789/16205
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